Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01665 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01665 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01665 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01665 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01665 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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