Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Usf3B2RUQ2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms