Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Atp8b5A3FIN4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms