Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms