Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2X1

Hnrnpf, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpfQ9Z2X1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
HnrnpfQ9Z2X1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms