Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Robo3Q9Z2I4 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms