Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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