Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms