Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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