Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 4930568E12Rik-202ENSMUST00000216694 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm34776-201ENSMUST00000219415 1140 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ube2d3-201ENSMUST00000106291 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 A730032A03Rik-202ENSMUST00000143202 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm28989-201ENSMUST00000187867 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC153364.1-201ENSMUST00000220081 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ispd-203ENSMUST00000221177 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms