Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms