Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms