Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43511-201ENSMUST00000197084 2297 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38336-201ENSMUST00000193040 2549 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gtf3c6Q9D8P7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gtf3c6Q9D8P7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gtf3c6Q9D8P7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gtf3c6Q9D8P7 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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