Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nop56Q9D6Z1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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