Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Fndc8Q9D2H8 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms