Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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