Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms