Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf17Q99MV7 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf17Q99MV7 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms