Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Setd3Q91WC0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms