Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms