Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms