Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Amigo3Q8C2S7 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms