Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms