Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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