Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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