Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms