Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop58Q6DFW4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms