Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms