Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Arhgef40Q3UPH7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgef40Q3UPH7 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms