Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms