Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Usp30Q3UN04 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.9 ms