Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms