Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mill2-206ENSMUST00000228493 2043 ntAPPRIS P4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Rnf122-201ENSMUST00000046941 3582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms