Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms