Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GscQ02591 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms