Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms