Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pde1bQ01065 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms