Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RhodP97348 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RhodP97348 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms