Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms