Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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