Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms