Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nphp4P59240 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms