Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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