Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms