Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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