Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms