Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RxrgP28705 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms