Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NapbP28663 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NapbP28663 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms