Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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