Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms